中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与相助者将CRISPR技术与拓展遗传暗码技术联合,开发出一种新型活细胞DNA成像技术——CRISPR PRO-LiveFISH。该技术于此前的CRISPR LiveFISH要领的基础上进行了体系性进级,初次引入扩大遗传字母表中的正交非自然碱基对于,显著晋升了探针标志的敏捷度。相干论文11月6日发表在《天然—生物科技》。
三维基因组互作与表不雅遗传润色是基因表达调控的主要因素,其动态变化与细胞生长发育和癌症等疾病的发生生长紧密亲密相干。解析染色质于活细胞内的时空动态,是理解基因调控机制的主要科学问题。现有基在CRISPR-Cas体系的成像要领可靶向内源基因序列,但仍受体系繁杂性及敏捷度的限定,于非重复序列成像,多位点成像和原代细胞运用方面仍面对挑战。
研究经由历程联合扩大遗传暗码技术与sgRNA理性设计,CRISPR PRO-LiveFISH技术为动态三维基因组研究提供了新的活细胞多色成像工具,适用在非重复DNA序列的动态标志以和原代细胞成像。借助该工具,研究团队体系展现了染色质动态与表不YABO鸭脖官网雅遗传之间的联系关系纪律、解析了增强子-启动子(E-P)的时空互作特征,并阐释了转录共激活因子BRD4于维持超级增强子三维互作中的要害作用,从而深化了对于表不雅调控及三维基因组时空动态调控机制的理解。
清华年夜学生命科学学院王海峰研究员、中国科学院生物物理研究所方显杨研究员及清华年夜学生命科学学院颉伟教授是该论文的配合通信作者。清华年夜学博士生刘美铄、黄可韵及已经卒业博士生张杰(现为生物物理所方显杨组博士后)为论文配合第一作者。该研究遭到国家重点研发计划、国家天然科学基金、中国科学院战略性先导科技专项(B类)及北京市天然科学基金的撑持。
相干论文信息:https://doi.org/10.1038/s41587-025-02887-3
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